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黄杰，博士，研究员，博士生导师。入选海外高层次人才青年项目、四川大学“双百人才工程”计划。2018年6月博士毕业于南京农业大学，随后于2018年6月至2021年12月在南京农业大学从事博士后研究。2022年1月至2026年2月，赴英国牛津大学开展博士后的研究工作。在植物-病原菌互作领域取得了一系列开创性与引领性的突破性成果。相关研究以第一作者或通讯作者（含共同）发表于Nature Communications（2篇）、PNAS、Current Biology、Molecular Plant、Trends in Plant Science、Advanced Science、New Phytologist等国际著名期刊，其中2篇入选 ESI 高被引论文，学位论文获评江苏省优秀博士学位论文。多次受邀在国际会议作学术报告，并获得 Google DeepMind 在“全球粮食安全与人工智能应用”领域的专题访问。现任欧洲玛丽居里学者华人学会的执行委员，同时还担任BioDesign、aBIOTECH、New crops等杂志的青年编委，获国内外同行高度认可。
研究方向：
1. 人工智能与植物免疫
2024年诺贝尔化学奖授予了在“AI 驱动的蛋白质结构预测与设计”领域作出开创性贡献的研究，充分彰显了人工智能对生命科学的推动作用。未来，实验室将深度融合生成式人工智能、结构生物学与功能验证手段，以水解酶-抑制子互作系统为核心研究对象，采用蛋白质结构预测与蛋白质的从头设计（de novo design）策略，实现对免疫相关蛋白功能的精准改造与设计，推动大豆、玉米等重要作物抗病性改良及精准育种研究。
2. 化学生物学与植物免疫
点击化学以其高效、专一、可控的反应特性，使复杂分子的构建如同“拼积木”般快速而可靠，荣获2022年诺贝尔化学奖。黄杰博士先前已利用点击化学策略合成多种功能化小分子探针，未来将进一步结合化学蛋白质组学技术，系统解析大豆、玉米等重要农作物在不同外界刺激条件下水解酶活性动态变化的全景图谱，并深入揭示其背后的分子调控机制，为挖掘新型抗病基因资源提供理论基础。
3. 植物合成生物学
植物反应器作为合成高价值物质（如药物、疫苗、抗体等）的生物技术平台，在制药和生物技术领域展现出巨大潜力。Medicago公司曾利用烟草表达体系，生产了全球首款获批上市的植物源新冠疫苗。与传统微生物或动物细胞表达体系相比，植物反应器具有周期短、成本低和规模化发展灵活等优势。未来，实验室将重点围绕高价值蛋白的植物高效表达体系开展研究，聚焦抗病毒蛋白、光裂合酶、PET塑料降解酶、生物催化酶等关键蛋白的高效表达与生产优化，推动植物反应器在生物医药与绿色生物制造领域的应用。
发表文章：（#共同一作，*通讯作者）
1. Huang, J., A. Penrose, L. Ossorio Carballo and R. A. L. van der Hoorn* (2026). "Pathogen-inspired engineering of plant protease enhances late blight resistance." Proc Natl Acad Sci U S A 123(2): e2524700123.
2. Huang, J., and R. A. L. van der Hoorn* (2026). "The ancestral salicylic acid biosynthesis pathway in plants." Trends Plant Sci 31(1): 17-19.
3. Huang, J., and R. A. L. van der Hoorn* (2025). "RD21-like proteases: key effector hubs in plant–pathogen interactions." Journal of Experimental Botany 76 (15), 4212-4219.
4. Huang, J.*, and M. Schuster* (2025). "Plant-pathogen interactions: Receptor shedding adds a new layer to immune regulation." Current Biology 35(16): R813-R815.
5. Yan, D., J. Huang*, F. Tian, H. Shu, H. Chen, Q. Peng, H. Wu, J. Zhao, A. S. N. Reddy, G. Li, Y. Wang and S. Dong* (2025). "A Phase-Separated SR Protein Reprograms Host Pre-mRNA Splicing to Enhance Disease Susceptibility." Adv Sci12(27): e2500072.
6. Homma, F.#, J. Huang# and R. A. L. van der Hoorn* (2023). "AlphaFold-Multimer predicts cross-kingdom interactions at the plant-pathogen interface." Nat Commun 14(1): 6040.
7. Huang, J., X. Lu, H. Wu, Y. Xie, Q. Peng, L. Gu, J. Wu, Y. Wang, A. S. N. Reddy and S. Dong* (2020). "Phytophthora Effectors Modulate Genome-wide Alternative Splicing of Host mRNAs to Reprogram Plant Immunity." Mol Plant 13(10): 1470-1484.
8. Huang, J., L. Chen, X. Lu, Q. Peng, Y. Zhang, J. Yang, B. Y. Zhang, B. Yang, J. R. Waletich, W. Yin, X. Zheng, Y. Wang and S. Dong* (2019). "Natural allelic variations provide insights into host adaptation of Phytophthora avirulence effector PsAvr3c." New Phytol 221(2): 1010-1022.
9. Huang, J., L. Gu, Y. Zhang, T. Yan, G. Kong, L. Kong, B. Guo, M. Qiu, Y. Wang, M. Jing, W. Xing, W. Ye, Z. Wu, Z. Zhang, X. Zheng, M. Gijzen, Y. Wang and S. Dong* (2017). "An oomycete plant pathogen reprograms host pre-mRNA splicing to subvert immunity." Nat Commun 8(1): 2051.
